Entzifferung des Erbguts des Menschen war das bisher anspruchsvollste Projekt der Genomik, welche sich mit dem Genom - also dem Erbgut von Menschen, Tieren, Pflanzen und Mikroorganismen beschäftigt. Aus der Genomik entstand als nächstes Forschungsgebiet folgerichtig die Proteomik, die sich vorgenommen hat, alle in einer Zelle oder einem Organismus befindlichen Eiweißstoffe (Proteine) aufzuklären. In Analogie zu den Begriffen Genomik und Proteomik bezeichnet Metabolomik die Erforschung des Metaboloms, d. h. die Erforschung der Gesamtheit der Metaboliten (Stoffwechselprodukte) eines Lebewesens.
Zielsetzung bei der Metabolomik ist es, aus einfach zu erhaltenden Körperproben wie Speichel, Urin oder Blut ein Profil über die Stoffwechselprodukte eines Menschen zu erstellen und hierüber Aussagen über dessen Gesundheitsstatus abzuleiten. Ein Vorteil der Metabolomik ist, dass es sich bei vielen Metaboliten um kleine Moleküle handelt, die relativ einfach zu bestimmen sind. Von Nachteil sind allerdings sowohl die starken Schwankungen bei ein und derselben Person (beispielsweise im Verlauf von Tag und Nacht) als auch zwischen verschiedenen Individuen. Zudem beeinflussen das Ernährungsverhalten und andere Lebensbedingungen das Profil der Metabolite. Zunächst muss man also eine umfangreiche Datenbasis generieren, um daraus später vielleicht Aussagen über den Gesundheitszustand oder über die Veranlagung (Prädisposition) für eine bestimmte Erkrankung ableiten zu können.
