Die Anzahl der infektiösen Viruspartikel wird häufig unter Verwendung des TCID50-Assays (Median Tissue Culture Infectious Dose) quantifiziert. Der Assay funktioniert durch Hinzufügen einer Reihenverdünnung der Virusprobe zu Zellen in einem 96-Well-Plattenformat. Der Zelltyp wird spezifisch ausgewählt, um eine zytopathische Wirkung (CPE) zu zeigen, d. H. Morphologische Veränderungen bei Infektion mit dem Virus oder Zelltod. Nach einer Inkubationszeit werden die Zellen auf CPE oder Zelltod untersucht und jede Vertiefung wird als infiziert oder nicht infiziert klassifiziert. Es sind auch kolorimetrische oder fluorometrische Auslesungen möglich, die die Assayempfindlichkeit erhöhen können. Die Verdünnung, bei der 50% der Vertiefungen einen CPE aufweisen, wird zur Berechnung der TCID50 der Virusprobe verwendet. Diese Berechnung kann im Allgemeinen durch eine Vielzahl von mathematischen Ansätzen durchgeführt werden, z. B. die Spearman-Karber-Methode oder die Reed-Muench-Methode. Die Virusmenge wird als TCID50 / ml ausgedrückt.